2010年4月，园内已收集到植物约9000种，其中最多的属华东地区的植物，共有1500余种上海辰山植上海辰山植物园中的天竺桂物园也由此成为拥有华东区系植物最多的植物园2010年12月，辰山植物园收集的珍稀濒危活植物（即国家一、二级保护植物）达到107种，其中包括羊角槭（Acer yangjuechi Fang）、普陀鹅耳枥（Carpinusputoensis Cheng）、夏蜡梅（Calycanthus chinensis Cheng et S. Y. Chang）、伯乐树（Bretschneidara sinensis Hemsi）等品种。这些植物中，部分为野外仅存若干株的珍贵物种，有的则具有极强观赏性，还有不少是价值很高的药用植物和野生水果植物2012年9月28日，来自哈尔滨师范大学的刘保东教授向植物园捐赠了国家一级保护植物中华水韭（Isoetes sinensis）的孢子人工繁殖苗。刘保东教授于2005年首次人工繁殖成功这一极度濒危的物种，落户植物园的植株将用于用于科普教育和物种保育植物园的长远目标是搜集全球3万种植物