洋葱常见病害有黑斑病、紫斑病、炭疽病、霜霉病、软腐病、锈病等。(1) 黑斑病。初发病时，在叶片和花茎上形成黄白色长圆斑，发病后期，病斑上密生黑色短绒状霉层并具有同心轮纹。鳞茎初发时呈水浸状，而后病斑上生出霉层而变黑。在发病初期，用 75%百菌清可湿性粉剂600倍液、50%扑海因可湿性粉剂1 200~ 1 500倍液喷洒。
  一般每隔7~10 d1次，连续喷3~4次。(2) 紫斑病。主要为害叶片和种株的花梗，病部软化易折断。种株花梗发病率高，致使种子皱缩，不能充分成熟。收获前还能危害鱗茎导致腐烂。选用无病种子。发病初期喷75%百菌清可湿性粉剂500~600倍液，或58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液，每隔7~10 d喷1次，共喷3~4次。
  (3) 炭疽病。此病的特征是轮生的黑色小粒点会突破表皮，用扩大镜可看黑色刚毛，湿度高时，可产生乳白色孢子堆。栽培时，选用抗病品种，最好与非葱蒜类作物实行2~3年轮作。喷洒 75%百菌清或50%托布津可湿性粉剂600倍液，或1 : 1 : (160~240)等量式波尔多液进行预防，如果发现病株，可连治2~3次。
  (4) 霜霉病。主要为害叶部和采种株的花薹。本病的特征为病斑较大、长椭圆形、黄白色，雨后病斑变为灰白色，潮湿时病斑上长出稀疏白霉，高温时长出灰紫色霉。在发病初期，及时进行药剂防治，可用75%百菌清可湿性松剂对水600倍液、60%琥乙膦铝可湿性粉剂对水500倍喷施、1 : 1 : 240波尔多液等药剂，每隔 5~7 d喷1次，连续防治2~3次。
  (5) 软腐病。多在鳞茎膨大期发病。在外叶下部产生灰白色、半透明的病斑，使叶鞘基部软化而倒伏，鳞茎颈部出现水漫状凹陷，不久鳞茎内部腐烂，有汁液溢出并有恶臭。注意肥水管理，防止氮肥过量。在田间发病初期，喷洒50%琥胶肥酸铜、新植霉素稀释4 000倍液。
  视病情连续进行2~3次防治。(6) 锈病。主要发病部位是叶和花薹，很少在花器上发病。发病初期病部表面稍凸出，中心带有橙黄色的病斑，以后表皮破裂散出橙黄色粉末。增施农家肥，附加磷、钾肥，提高作物健康水平。在发病初期可用15%粉锈宁可湿性粉剂2 000~2 500倍液、65% 代森锌可湿性粉剂500~600倍液等喷洒，连续防治2~3次。
  洋葱常见的虫害主要有葱潜叶蝇、葱蓟马、葱蝇等。用2。5% 溴氰菊酯乳油1 500~2 000倍液、10%吡虫啉可湿性粉剂2 000~ 3 000倍液、1。 8%齐墩螨素乳油2 000~3 000倍液喷雾防治。洋葱甘蓝夜蛾可用2 溴氰菊酯乳油2 000~3 000倍液、1。
   8%齐墩螨素乳油2 000~3 000倍液防治。