辰山植物园是以华东原生植物的收集展示为主，长期目标是收集3万种植物，目前已收集了9000余种各具特色的植物种类，其华东原生植物的拥有量为全国第一。辰山植物园自2005年开始向世界各地派出采集队伍，收集各种有经济、科学和园艺价值的植物。广泛收集木兰科、蔷薇属、樱属、苹果属、鸢尾属、水生植物、旱生植物、药草植物、经济植物、珍稀濒危植物等专科专属或专类植物以及温室植物，并按照科学的方式进行养护和记录。其中，海岛特有植物的收集，是辰山植物园的一个特色。目前已成功收集的海岛特有植物有普陀樟、舟山新木姜子、普陀鹅耳栎、单叶蔓荆等，既有保护意义彰显的植物物种，又有观赏性强的野生种类。植物园内的“宝贝”还有被舟山当地人称为“佛光树”的舟山新木姜子、何氏红豆树、连香树、夏蜡梅、南方红豆杉、金缕梅、银鹊树、金钱松、伯乐树、蓝果树、福建柏等。

辰山植物园里面，有个月季园，里面的月季花品种非常多，有上百种。还有个鸢尾花园，里面也有上百个品种。每当春季4月下旬到5月上旬，花开满园，非常漂亮！还有秋天的向日葵，数十万枝，花开满地，浩浩荡荡。其他的，看季节有樱花，锦带，各色药用植物，水生莲花睡莲等等等等。